げっ歯類の歯は一生伸び続けます。（われわれの爪と同じですね。）
牧草などの繊維質の食べ物で十分に咀嚼し、すり減らし正常な長さに保つことが必要です。ペレットや野菜中心の食生活を続けると、咬み合せが悪くなり、舌や頬に傷を作ったり、歯の根の変形や炎症を招き、食事が採れなくなることがあります。
遺伝的背景も疑われ、小顔のうさぎに発生が多い傾向があります。「よだれが出る、食べない、食べにくい、歯ぎしりをする。」などの症状が見られた場合注意が必要です。
予防には、良質の牧草中心の食生活が重要です。健康診断時に、歯列の検査も実施しています。重度な変形を伴った歯には、性格や症状に応じて麻酔下または無麻酔下での歯科処置が必要です。

うさぎの消化管は、ち密で繊細なシステムによって制御されています。盲腸には、非常にたくさんの微生物（正常細菌）が住んでおり、これが正常発酵を行うことで栄養をえています。環境や食事の変化、他の病気のストレスなどによりこのシステムが崩れたときに、胃腸疾患に陥ります。猫のように毛を吐き出せないウサギには、結果的に胃内に毛球が形成されたり、毛球自身が、症状にかかわることも多いため、総称として毛球症と呼ばれることも多いです。

予防には、
①出来るだけストレスを避ける
②お部屋で遊ばせる時なども、布や紙きれなどの異物摂取に気を付ける
③日頃から、ブラッシングや環境の掃除を細目に行うことで、飲み込む毛の量を減らす
④水分を十分取る
⑤牧草などの高繊維食を心がける
…などが大切です。

急に元気がなくなる、お腹が張る、食餌を残す（または食べない）、便をしない、異常な便（下痢、形がおかしい、小さい）をするなどの症状があれば、注意が必要です。急性で、致死的なものもあるため、早めにご相談下さい。

うさぎは犬猫と違い摂取しすぎたカルシウム分を尿中に排泄しています。そのため、食餌中のカルシウムが過剰だとペースト状のカルシウム分を多量に含むカルシウム尿症におちいる可能性があります。
中には、膀胱内で結石を形成したりそれが尿道に詰まってしまうこともあります。
トイレに行くが尿がでない、出ているがその量が少ない、色など見た目がおかしい場合はこの可能性がありますので、早めに相談してください。 また、犬猫同様にシニア世代のうさぎには腎不全も見られます。

うさぎは強力な筋力を持っている割にそれを支える骨が非常にもろく、性格的に臆病な性格の子も多いため、落下事故や踏みつけ事故ばかりではなく、びっくりして暴れたり、怒ってダンピング（脚の踏み鳴らし）しただけでも骨折や脱臼を起こすことがあります。
骨が繊細であるがために整復が難しい場合も多いですが、放置すると折れた骨が筋肉や皮膚を貫通してしまうこともあるため早目の対処（固定など）が必要です。
常日頃から、抱いたり撫でてあげたりのハンドリングにならし、性格の穏やかなうさぎに育ててあげること、床が滑ったり爪や脚が引っかかったりしにくいように注意し、突然驚かせるなどのストレスを避けることが大切です。

微胞子虫（Encephalitozoon cuniculi）が中枢神経や腎臓に寄生し肉芽腫性炎症を起こすことで、様々な症状を出す病気です。
障害される場所により斜頸、旋回、痙攣、後躯麻痺、開張脚、目の炎症など様々な症状が見られます。
前庭障害の結果起こる斜頸、眼振などの症状は、パスツレラ症との区別が難しいことがあります。血液中の抗体価を測定することで、感染の有無をある程度の精度で調べることができます。
母うさぎなどが尿中に排泄した胞子を経口摂取することで感染します。しかし、感染しているうさぎのすべてが発症するわけではなく、病気の全容はまだ解明されていません。治療では、2次的なトラブルの予防と、効果の期待できる駆虫剤の投薬が必要です。

オスでは、精巣腫瘍が多くみられます。
左右の精巣の大きさに差が認められるようであれば疑います。良性腫瘍が多いですが、中には悪性のものもあり注意が必要です。腫大が見られた場合、全身状態が安定していれば去勢手術を検討します。ケンカやマーキング行動を抑えるためにも、若齢期の去勢手術もおすすめしています。

メスでは、子宮内膜過形成、子宮腺癌、子宮線種、子宮筋腫、子宮水腫、子宮蓄膿症などの子宮疾患が多くみられます。
中でも、子宮腺癌は悪性度が高いものも多く、発見時にすでに肺などに遠隔転移が見られることもあります。 症状は、元気食欲の低下、血尿（不正出血）などです。2歳を過ぎると発生が多くなり、5歳を過ぎたメスうさぎの80%に見られるとの報告もあります。最善の予防法は、避妊手術（子宮と卵巣の切除）です。